More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2477 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
199 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
199 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
210 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
202 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.16 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.62 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.04 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.04 
 
 
205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.86 
 
 
200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.71 
 
 
200 aa  117  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.81 
 
 
202 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.46 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.04 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.79 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.3 
 
 
205 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.08 
 
 
195 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.13 
 
 
205 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
201 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.13 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
197 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
198 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.81 
 
 
204 aa  111  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.94 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.98 
 
 
205 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  33.7 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  33.7 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  35.03 
 
 
199 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
204 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
200 aa  108  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
204 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
204 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
204 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
203 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.43 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
209 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.84 
 
 
200 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
203 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
223 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
193 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  34.05 
 
 
206 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
193 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0321  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  33.52 
 
 
203 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.78 
 
 
208 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
198 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
202 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.15 
 
 
203 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  31.84 
 
 
200 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
196 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.96 
 
 
197 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
199 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
197 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.26 
 
 
197 aa  104  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
193 aa  104  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0811  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
202 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
201 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
194 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.7 
 
 
204 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.12 
 
 
194 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
199 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.16 
 
 
201 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.71 
 
 
190 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
194 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>