More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12613 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
196 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  78.46 
 
 
196 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  78.46 
 
 
196 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  78.46 
 
 
196 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  71.65 
 
 
195 aa  278  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  70.62 
 
 
195 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  59.7 
 
 
199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.78 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.5 
 
 
198 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  53.66 
 
 
206 aa  181  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.49 
 
 
199 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.02 
 
 
207 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.08 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.98 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.49 
 
 
207 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
200 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.69 
 
 
196 aa  154  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.69 
 
 
206 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.26 
 
 
200 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  51 
 
 
200 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.84 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.31 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.74 
 
 
209 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
200 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  48.52 
 
 
202 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.55 
 
 
212 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.28 
 
 
214 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.86 
 
 
247 aa  141  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  48.26 
 
 
206 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  42.93 
 
 
205 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.84 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.06 
 
 
206 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.24 
 
 
197 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.68 
 
 
208 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  43.98 
 
 
239 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.82 
 
 
197 aa  121  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.82 
 
 
204 aa  121  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
200 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.73 
 
 
204 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.06 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  33.49 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
194 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  39.18 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.61 
 
 
193 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
209 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.02 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
193 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
200 aa  111  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.64 
 
 
194 aa  111  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
200 aa  111  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
198 aa  110  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.51 
 
 
197 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.83 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.41 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.01 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.59 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.18 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  35.32 
 
 
194 aa  109  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
194 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.6 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  30.3 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
202 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.61 
 
 
208 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 
187 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.57 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
201 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.86 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.68 
 
 
199 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.14 
 
 
200 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.25 
 
 
197 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
195 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
220 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
199 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
190 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0457  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.41 
 
 
204 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
214 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
193 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
194 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.61 
 
 
193 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.3 
 
 
198 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>