More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1112 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
197 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  83.67 
 
 
197 aa  291  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.76 
 
 
195 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.82 
 
 
197 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0086  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.39 
 
 
192 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.43 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  43.15 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  44.69 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.62 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.13 
 
 
194 aa  144  6e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.21 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.83 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.83 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.83 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.39 
 
 
196 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.5 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  43.06 
 
 
209 aa  129  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
195 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.79 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.71 
 
 
207 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.36 
 
 
202 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.5 
 
 
190 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
201 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
195 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.06 
 
 
206 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
201 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.69 
 
 
201 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.89 
 
 
201 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.7 
 
 
198 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
214 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
203 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.89 
 
 
197 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.33 
 
 
193 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
193 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
213 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.71 
 
 
199 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.39 
 
 
205 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.58 
 
 
187 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
207 aa  121  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
200 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
200 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.54 
 
 
197 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
204 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.59 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.5 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.11 
 
 
193 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.56 
 
 
202 aa  117  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.5 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.42 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.68 
 
 
202 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.92 
 
 
197 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.02 
 
 
194 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.82 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.32 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.92 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  34.69 
 
 
194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.69 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
201 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.98 
 
 
202 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
200 aa  112  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.34 
 
 
193 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.18 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  35.96 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.04 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4665  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.27 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.19 
 
 
214 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  37.79 
 
 
194 aa  111  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.55 
 
 
199 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.06 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.33 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.55 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.07 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.83 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>