More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2302 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
214 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  85.51 
 
 
213 aa  347  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.93 
 
 
214 aa  205  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.71 
 
 
207 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.83 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.21 
 
 
202 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.24 
 
 
202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.25 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.29 
 
 
200 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.5 
 
 
206 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  47.91 
 
 
205 aa  165  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.89 
 
 
202 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.56 
 
 
206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.04 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.04 
 
 
199 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.64 
 
 
209 aa  158  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.76 
 
 
198 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.55 
 
 
206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.51 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.26 
 
 
197 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.27 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.27 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.27 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  47.67 
 
 
196 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.37 
 
 
208 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.5 
 
 
212 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.83 
 
 
200 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.28 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.26 
 
 
207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.79 
 
 
195 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.02 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.56 
 
 
200 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  45.41 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
195 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
197 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.2 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.25 
 
 
199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
204 aa  118  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1268  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
204 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.20539  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.76 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  39.01 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  45 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.86 
 
 
201 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.88 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  34.83 
 
 
208 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.28 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.95 
 
 
203 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.31 
 
 
195 aa  111  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.23 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.96 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.83 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.36 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
194 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  35.92 
 
 
194 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1323  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  42.35 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0418911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
194 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
207 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  32.96 
 
 
194 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1206  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.32 
 
 
200 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000238701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
200 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.17 
 
 
199 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  35.41 
 
 
204 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
197 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0894  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.56 
 
 
210 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00161936  normal  0.093504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.42 
 
 
206 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.31 
 
 
189 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.250827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.9 
 
 
201 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.73 
 
 
194 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
209 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0577  Holliday junction resolvasome, DNA-binding subunit  33.68 
 
 
194 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
193 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
205 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.36 
 
 
195 aa  101  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.12 
 
 
197 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.07 
 
 
200 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.07 
 
 
200 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  36.78 
 
 
194 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
202 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
200 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
193 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.76 
 
 
208 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
202 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
199 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.01 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.57 
 
 
193 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.31 
 
 
199 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.43 
 
 
195 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
220 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.59 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.62 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>