More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2110 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
202 aa  391  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  68.45 
 
 
202 aa  245  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  64.36 
 
 
200 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  61.88 
 
 
196 aa  230  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.44 
 
 
206 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.29 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  62.25 
 
 
206 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.4 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.08 
 
 
202 aa  208  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.27 
 
 
200 aa  205  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  56.72 
 
 
206 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.13 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  59.9 
 
 
200 aa  198  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.55 
 
 
208 aa  191  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.75 
 
 
199 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  54.84 
 
 
247 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.45 
 
 
198 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  60 
 
 
200 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.96 
 
 
205 aa  177  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.55 
 
 
209 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  50.96 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.75 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  50 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.98 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.21 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.49 
 
 
213 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  57.14 
 
 
239 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.45 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.04 
 
 
196 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.77 
 
 
196 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.77 
 
 
196 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.77 
 
 
196 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.78 
 
 
199 aa  144  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.79 
 
 
195 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  44.83 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
195 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  41.87 
 
 
197 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.11 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.49 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
199 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.02 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.83 
 
 
197 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
197 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  40.22 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.08 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.08 
 
 
202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.96 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.35 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.78 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
207 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.1 
 
 
194 aa  126  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  43 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.21 
 
 
194 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.24 
 
 
200 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.98 
 
 
209 aa  124  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  40.53 
 
 
206 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  37.16 
 
 
199 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.44 
 
 
198 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
205 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
205 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.43 
 
 
201 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
205 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.31 
 
 
197 aa  122  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
205 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.43 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.18 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.77 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.49 
 
 
201 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
199 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.49 
 
 
201 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.98 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  41.49 
 
 
194 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
200 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.51 
 
 
203 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.26 
 
 
200 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.6 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1797  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.49 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.42 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.43 
 
 
194 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.34 
 
 
208 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.35 
 
 
199 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.56 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.16 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
193 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.05 
 
 
206 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  33.98 
 
 
194 aa  115  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.42 
 
 
206 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.56 
 
 
197 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.03 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>