More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3825 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3825  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
195 aa  377  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  94.36 
 
 
195 aa  361  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  79.08 
 
 
196 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  70.62 
 
 
196 aa  275  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  55.28 
 
 
199 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.28 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.85 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1935  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.97 
 
 
199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3395  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.45 
 
 
207 aa  158  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00278946  hitchhiker  0.00000769998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17520  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  48.02 
 
 
206 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.28 
 
 
205 aa  151  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.32 
 
 
207 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  46.53 
 
 
200 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.77 
 
 
202 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3054  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.53 
 
 
209 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.6375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.12 
 
 
196 aa  136  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2064  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.71 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.5 
 
 
200 aa  135  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1809  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.96 
 
 
200 aa  134  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2302  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0640436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1799  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.23 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.215685  hitchhiker  0.000114407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2032  Holliday junction DNA helicase RuvA  39 
 
 
213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000340991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1993  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.67 
 
 
200 aa  128  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0230385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.05 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2094  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.38 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  40.86 
 
 
247 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.29 
 
 
197 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2110  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.93 
 
 
202 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.71 
 
 
212 aa  121  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6112  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  44.81 
 
 
206 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  40.59 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12890  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.43 
 
 
214 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.419715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.27 
 
 
209 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.1 
 
 
204 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.38 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.97 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3772  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.37 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000550538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.66 
 
 
195 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.31 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5145  DNA recombination protein RuvA  39.34 
 
 
239 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0031109  decreased coverage  0.000116053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
199 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.3 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0838  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.15 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
199 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.68 
 
 
193 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.13 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.36 
 
 
187 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0726  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.39 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
192 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
197 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.92 
 
 
202 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.75 
 
 
200 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.82 
 
 
220 aa  105  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1732  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 
200 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.25398  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1699  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 
200 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.5 
 
 
200 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3832  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.8 
 
 
194 aa  104  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1706  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.24 
 
 
193 aa  104  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.890082  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
203 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.5 
 
 
197 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.83 
 
 
199 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1631  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.71 
 
 
193 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
197 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  35.27 
 
 
208 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
200 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.77 
 
 
211 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2323  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
201 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
209 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.16 
 
 
196 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.05 
 
 
193 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.85 
 
 
190 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  41.67 
 
 
206 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2096  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.5 
 
 
196 aa  101  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
198 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.68 
 
 
201 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
200 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
201 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
202 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.36 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.73 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.59 
 
 
207 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
200 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 
208 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4464  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
196 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.37 
 
 
209 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.95 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  30.81 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
193 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
193 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>