More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2423 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.84 
 
 
205 aa  175  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.58 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.77 
 
 
205 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.84 
 
 
205 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.62 
 
 
206 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.61 
 
 
205 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.61 
 
 
205 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.36 
 
 
209 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.73 
 
 
205 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.49 
 
 
205 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.91 
 
 
205 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.89 
 
 
205 aa  154  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.79 
 
 
204 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.44 
 
 
205 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.12 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.33 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.66 
 
 
205 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.03 
 
 
208 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.03 
 
 
208 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.83 
 
 
205 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.42 
 
 
205 aa  147  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.95 
 
 
205 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.95 
 
 
205 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.55 
 
 
217 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  46.32 
 
 
212 aa  141  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.26 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.01 
 
 
204 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.07 
 
 
205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.07 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.6 
 
 
199 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.26 
 
 
200 aa  131  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.78 
 
 
199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.07 
 
 
204 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  40 
 
 
224 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
197 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.87 
 
 
223 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.03 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.97 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.79 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.97 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.38 
 
 
223 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.35 
 
 
202 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
197 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.6 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.26 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  34.74 
 
 
208 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.11 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
197 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.62 
 
 
197 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.62 
 
 
205 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.1 
 
 
205 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
220 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
203 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.96 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  31.28 
 
 
193 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.79 
 
 
202 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.16 
 
 
224 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.21 
 
 
199 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.18 
 
 
202 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.16 
 
 
224 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
206 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
199 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.37 
 
 
199 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.8 
 
 
197 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.46 
 
 
204 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.09 
 
 
203 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6947  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
195 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
200 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.91 
 
 
199 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.91 
 
 
201 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.02 
 
 
209 aa  102  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.02 
 
 
201 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.91 
 
 
201 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  29.03 
 
 
199 aa  101  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.09 
 
 
194 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.48 
 
 
198 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.02 
 
 
201 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.58 
 
 
200 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.5 
 
 
209 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.21 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
199 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.58 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1369  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.83 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0441824 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.75 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.86 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.8 
 
 
199 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.15 
 
 
208 aa  99  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.87 
 
 
210 aa  99  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.67 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.07 
 
 
193 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0683  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.46 
 
 
190 aa  98.2  9e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.85 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>