More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0965 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  68.32 
 
 
224 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.78 
 
 
224 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.6 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.6 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  64.5 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  57.81 
 
 
223 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.65 
 
 
206 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.96 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.35 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.29 
 
 
205 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.64 
 
 
205 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.09 
 
 
205 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.21 
 
 
205 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.56 
 
 
205 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.21 
 
 
205 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.69 
 
 
205 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.21 
 
 
205 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  42.98 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.36 
 
 
199 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
205 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.44 
 
 
209 aa  153  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.35 
 
 
205 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  55.56 
 
 
204 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.12 
 
 
204 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.62 
 
 
208 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.74 
 
 
205 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.09 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.09 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.48 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  44 
 
 
205 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  54.07 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.29 
 
 
217 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.09 
 
 
199 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.59 
 
 
213 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.79 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.3 
 
 
204 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.54 
 
 
206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
205 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.07 
 
 
205 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.9 
 
 
202 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.32 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.25 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.63 
 
 
202 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.1 
 
 
200 aa  121  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
201 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.68 
 
 
201 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.97 
 
 
200 aa  118  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.73 
 
 
202 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15070  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  36.61 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180586  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.12 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
199 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.42 
 
 
187 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.94 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2016  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.273142  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.16 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.38 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.88 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.12 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
199 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0952  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.39 
 
 
197 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.72 
 
 
203 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
204 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.62 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1010  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.94 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.806868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.03 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.03 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  37.5 
 
 
206 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.82 
 
 
205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.03 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.87 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.31 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  37 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.29 
 
 
192 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.8 
 
 
205 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.56 
 
 
207 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.18 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.7 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  36.53 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.64 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>