More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0422 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0335  Holliday junction DNA helicase RuvA  65.52 
 
 
199 aa  218  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.642504  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  61.58 
 
 
199 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.51 
 
 
205 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  51.47 
 
 
205 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.2 
 
 
205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.78 
 
 
205 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.6 
 
 
208 aa  160  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.6 
 
 
208 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.15 
 
 
206 aa  158  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.03 
 
 
209 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.07 
 
 
208 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.24 
 
 
205 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.24 
 
 
205 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  44.33 
 
 
204 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.24 
 
 
205 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  49.52 
 
 
205 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.39 
 
 
205 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.1 
 
 
205 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.29 
 
 
205 aa  154  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  51.3 
 
 
212 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.8 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.28 
 
 
204 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.8 
 
 
205 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.78 
 
 
204 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.55 
 
 
205 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.88 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.14 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  45.77 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.01 
 
 
213 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.5 
 
 
224 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.67 
 
 
205 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  58.33 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
193 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  41 
 
 
193 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  50.48 
 
 
206 aa  134  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  47.32 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.52 
 
 
224 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.52 
 
 
224 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.04 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.23 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.23 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.86 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
201 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.23 
 
 
205 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.67 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0695  Holliday junction DNA helicase RuvA  43.16 
 
 
223 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.127346  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.87 
 
 
202 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1104  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.53 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.451698  normal  0.544618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.71 
 
 
202 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.26 
 
 
205 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3126  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.41 
 
 
197 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.735644  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0785  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.15 
 
 
204 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247616  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.13 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.09 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.29 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  38.65 
 
 
207 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.8 
 
 
200 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.488567  normal  0.0220774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.54 
 
 
203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.61 
 
 
194 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0477  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  39.5 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
204 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0530  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.38 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.44 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.84 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.94 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.94 
 
 
205 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  38.31 
 
 
205 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.59 
 
 
220 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.94 
 
 
205 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.42 
 
 
208 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.32 
 
 
205 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.94 
 
 
205 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.81 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  36 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
200 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
202 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
205 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.9 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.05 
 
 
205 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.43 
 
 
203 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.56 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  35.29 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.5 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>