More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0783 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0783  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  98.4 
 
 
188 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0801  Holliday junction DNA helicase RuvA  48.21 
 
 
188 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  42.6 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.81 
 
 
211 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.69 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  35.92 
 
 
206 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.82 
 
 
200 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
204 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.82 
 
 
200 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
209 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2363  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.47 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00132923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
203 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.37 
 
 
199 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.05 
 
 
202 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.68 
 
 
200 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  33 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  33 
 
 
203 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  32.47 
 
 
194 aa  105  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
207 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
197 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  104  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.67 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.95 
 
 
209 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
203 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.16 
 
 
196 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
197 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1363  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
202 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
199 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
201 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.74 
 
 
195 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.01 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
203 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07040  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  34.36 
 
 
197 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00385536  normal  0.295964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
206 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
201 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.65 
 
 
202 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.06 
 
 
199 aa  102  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0028  Holliday junction DNA helicase  31.82 
 
 
199 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.591728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
201 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2574  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.18 
 
 
195 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.334415  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.34 
 
 
209 aa  101  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  30 
 
 
202 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.33 
 
 
203 aa  101  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  101  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1691  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.85 
 
 
198 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  31.34 
 
 
203 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
199 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
199 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
205 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2114  Holliday junction DNA helicase RuvA  34 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.948496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.35 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2076  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.438835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2255  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
205 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  33 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  32.5 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.79 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.69 
 
 
223 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.81 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  35.42 
 
 
191 aa  99  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
205 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3204  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
202 aa  98.6  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.84 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.99 
 
 
198 aa  97.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.66 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
196 aa  97.1  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1455  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.86 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.71 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>