More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1455 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1455  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
199 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.33 
 
 
199 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2212  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.3 
 
 
204 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.8 
 
 
202 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2945  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.53 
 
 
209 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.016551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2494  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.08 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0783  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.86 
 
 
188 aa  96.3  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003923  holliday junction DNA helicase RuvA  27.72 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00197305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0760  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.86 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.85 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1771  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.65 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0290161  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1954  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.65 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.9 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.9 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
189 aa  92  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 
205 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01832  Holliday junction DNA helicase motor protein  29.65 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.263475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1779  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00140889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.27 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01820  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1325  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2091  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000143296  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0957  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2597  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.15 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.18 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.77 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0718  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.92 
 
 
207 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.96 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.65 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.76 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01600  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.09 
 
 
223 aa  88.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.87 
 
 
202 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  27.72 
 
 
206 aa  87.8  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.78 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.57 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01557  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.27 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1051  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.41 
 
 
186 aa  85.5  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2049  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.64 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774525  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.11 
 
 
204 aa  84.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.86 
 
 
197 aa  84.7  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2109  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.64 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.434147  normal  0.12473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2054  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.64 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1229  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.64 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0100145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1353  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.64 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  hitchhiker  0.00521266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1888  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.19 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.949715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1652  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.12 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.04 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3827  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.29 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.41 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0573  Holliday junction DNA helicase RuvA  35 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.838758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.77 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.28 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.12 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.77 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1667  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.82 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0801  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.05 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15330  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  28.81 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1151  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.55 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.233355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.21 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1795  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.95 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115786  normal  0.0993939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2522  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.43 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000919135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2516  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.05 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.89 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0807  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.013271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1222  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.55 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0890  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.23 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.65 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0820  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.23 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.03 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1211  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.23 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4268  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.42 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00764236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.82 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.82 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.82 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.82 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.37 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  30.53 
 
 
194 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.53 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.41 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.85 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.83 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0837  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.37 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0113  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.95 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1209  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.59 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1370  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  27.54 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.903698  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4540  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.72 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000252775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12320  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.59 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.91 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4506  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4651  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00216004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.56 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.05 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4555  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.03 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>