More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1113 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1113  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0320  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.46 
 
 
190 aa  178  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.219542  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0683  Holliday junction DNA helicase RuvA  46.97 
 
 
190 aa  167  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3522  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 
206 aa  121  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2638  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2725  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.2 
 
 
205 aa  118  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1212  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6908  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.13 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0574  holliday junction DNA helicase RuvA  36.22 
 
 
193 aa  115  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1290  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0005  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.86 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000354643  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_004310  BR1703  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1646  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0904  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.67 
 
 
208 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.232261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3605  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.41 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4805  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.68 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1372  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.3 
 
 
205 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0111  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  111  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3067  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.47 
 
 
205 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32025  normal  0.444921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2116  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.38 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.060055  normal  0.258281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4169  Holliday junction DNA helicase RuvA  39.31 
 
 
205 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0003  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.58 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0928  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
208 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157529  normal  0.130269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0964  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.24 
 
 
208 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0154601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4271  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
205 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.580412  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.08 
 
 
192 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0850  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.78 
 
 
205 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0150  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.74 
 
 
217 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1746  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.63 
 
 
204 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  0.827108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2905  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
204 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.366229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.67 
 
 
198 aa  101  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
199 aa  101  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3515  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.63 
 
 
204 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.541914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3178  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.71 
 
 
206 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2140  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.72 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.497203  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1088  DNA recombination protein RuvA  33.49 
 
 
212 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0181  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.16 
 
 
202 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.595877  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1840  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.61 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.175833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2181  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.55 
 
 
205 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.613402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  32 
 
 
200 aa  97.8  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1938  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00077844  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1884  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.51 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3220  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.573398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1217  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.32 
 
 
200 aa  96.7  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.713526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13950  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  30.05 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190718  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0452  Holliday junction resolvasome DNA-binding subunit  33.52 
 
 
208 aa  96.3  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0798924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2041  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0555  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2304  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00141893  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0422  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.66 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.199605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2043  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000236908  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2420  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.73 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000176513  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2207  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.29 
 
 
224 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.99 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.48 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2077  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000433363  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1956  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.24 
 
 
205 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00381182  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1661  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.66 
 
 
199 aa  94.4  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  31 
 
 
203 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.76 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01215  Holliday junction DNA helicase motor protein  34.36 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1901  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.76 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000334634  hitchhiker  0.000124168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
190 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.65 
 
 
197 aa  92.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0310  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.2 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.966825  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.34 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.61 
 
 
193 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0994  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.23 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.199668  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1231  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.84 
 
 
224 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2423  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.78 
 
 
213 aa  92  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3236  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.2 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.34 
 
 
201 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.2 
 
 
205 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.54 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.17 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0389  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.97 
 
 
200 aa  90.5  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174867  normal  0.0250824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.5 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12850  Holliday junction DNA helicase, RuvA subunit  32.47 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2033  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.58 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00030841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3345  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.61 
 
 
193 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.23 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.65 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.57 
 
 
193 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0269  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.02 
 
 
204 aa  89  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.61 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0390  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.63 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1013  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.14 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2572  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.1 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  32.98 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0965  Holliday junction DNA helicase RuvA  40.74 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2372  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.69 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.535319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>