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for query gene Rsph17029_3399 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3662  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  99.77 
 
 
426 aa  813    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3399  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  100 
 
 
426 aa  816    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.564421  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4430  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  62.74 
 
 
425 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.401258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3327  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  61.08 
 
 
426 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0751  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  61.37 
 
 
426 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0266659  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4500  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  58.25 
 
 
426 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.792831  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0415  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  59.67 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1557  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  58.25 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.063123  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2481  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.31 
 
 
425 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2051  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  57.14 
 
 
426 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1874  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.67 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.800904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0859  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  52.59 
 
 
425 aa  442  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.322805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3763  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.52 
 
 
426 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0325846  normal  0.0119854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2795  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.43 
 
 
426 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3384  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.05 
 
 
425 aa  428  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0761  DedA family integral membrane protein  54.01 
 
 
426 aa  418  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.676825  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3764  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  55.9 
 
 
425 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163437  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5332  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.5 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3886  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease protein yian  54.72 
 
 
425 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2568  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  56.13 
 
 
425 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0724541  hitchhiker  0.0000000110918 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0136  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.25 
 
 
425 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2840  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  55.19 
 
 
425 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126693  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3995  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease yian  54.72 
 
 
425 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4057  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease yian  54.72 
 
 
425 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.998541  normal  0.502761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3870  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease yian  54.72 
 
 
425 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3950  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease protein yian  54.72 
 
 
425 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.788142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3901  TRAP transporter, DctM subunit  54.48 
 
 
425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03430  predicted transporter  54.01 
 
 
425 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0132  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  54.01 
 
 
425 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3782  TRAP transporter DctM family protein  53.77 
 
 
425 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03381  hypothetical protein  54.01 
 
 
425 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4075  TRAP transporter DctM family protein  54.01 
 
 
425 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1611  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  48.11 
 
 
429 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0467023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0044  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  50.24 
 
 
430 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.520063  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1074  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  47.42 
 
 
426 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1523  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  46.48 
 
 
429 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0024  permease (transport protein)  47.04 
 
 
424 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3944  2,3-diketo-l-gulonate trap transporter large permease protein yian  53.52 
 
 
337 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5945  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.49 
 
 
428 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1745  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  42.16 
 
 
418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3456  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.74 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1822  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.99 
 
 
460 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00945671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2449  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.6 
 
 
425 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3874  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.14 
 
 
428 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0543  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.22 
 
 
426 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.47 
 
 
425 aa  262  8e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.155072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.94 
 
 
424 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0342  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.1 
 
 
430 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0609  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.67 
 
 
427 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.562631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0595  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.67 
 
 
427 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000619396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1375  hypothetical protein  39 
 
 
427 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2753  TRAP dicarboxylate transporter  40.63 
 
 
429 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.580382  normal  0.0302374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1931  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.08 
 
 
640 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.49 
 
 
427 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0983264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0662  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.96 
 
 
426 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.98 
 
 
459 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.68 
 
 
628 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3834  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.1 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563327  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2498  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.59 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.768752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2401  TRAP transporter, DctM subunit  36.59 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000128119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0702  TRAP dicarboxylate transporter, permease component  35.64 
 
 
621 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000972925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1049  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.42 
 
 
426 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0898  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.13 
 
 
426 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.23627  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2137  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.9 
 
 
427 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.68 
 
 
634 aa  253  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4093  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.1 
 
 
425 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3116  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.44 
 
 
422 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  hitchhiker  0.000905066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0521  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.71 
 
 
428 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.409753  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1687  TRAP transporter subunit DctM  36.59 
 
 
429 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00011098  normal  0.0463686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2121  C4-dicarboxylate transport system permease, large subunit  36.84 
 
 
427 aa  250  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.306053  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0369  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.23 
 
 
624 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0385  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.01 
 
 
430 aa  249  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2661  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  31.81 
 
 
462 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1167  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.17 
 
 
426 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0119515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2991  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.74 
 
 
427 aa  249  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0932755  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3212  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.5 
 
 
430 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4244  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.17 
 
 
426 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.525518  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2863  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.56 
 
 
428 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1335  putative transporter  39.84 
 
 
426 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1201  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.93 
 
 
426 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3266  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.37 
 
 
427 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341254  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02560  hypothetical protein  35.07 
 
 
426 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1185  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.93 
 
 
426 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0078152  normal  0.144434 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4766  TRAP transporter, DctM subunit  38.76 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.428747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3706  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.62 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4675  TRAP transporter, DctM subunit  38.52 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4449  TRAP transporter, DctM subunit  38.52 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3808  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.52 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0700836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2115  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  32.56 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288069  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3317  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  36.99 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00194447  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0484  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  38.04 
 
 
426 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.424428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2262  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.79 
 
 
441 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2136  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.04 
 
 
426 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486862  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3303  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.84 
 
 
426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.99332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.06 
 
 
635 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0331  trap dicarboxylate transporter- dctm subunit  34.81 
 
 
430 aa  243  6e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1574  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.41 
 
 
459 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_007644  Moth_0424  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  35.77 
 
 
426 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0713218 
 
 
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NC_008463  PA14_15180  putative transporter  40.53 
 
 
426 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373658  hitchhiker  0.00000309479 
 
 
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NC_011661  Dtur_1772  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.92 
 
 
427 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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