More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0925 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.34 
 
 		 596 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0925  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 594 aa  1212    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.349332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4282  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.27 
 
 		 596 aa  838    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.67 
 
 		 605 aa  787    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220712  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2926  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.83 
 
 		 596 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.83 
 
 		 596 aa  918    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1225  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.39 
 
 		 596 aa  844    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311938  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1215  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  61.68 
 
 		 593 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1555  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  55.03 
 
 		 597 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000406482  normal  0.0195693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.73 
 
 		 596 aa  844    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272289  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6368  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  75.59 
 
 		 594 aa  933    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  71.16 
 
 		 600 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2548  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  77.1 
 
 		 594 aa  953    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2265  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.21 
 
 		 598 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.086163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2975  Acyl-CoA dehydrogenase  74.83 
 
 		 596 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0514  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.79 
 
 		 595 aa  794    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1298  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  72.59 
 
 		 596 aa  865    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939697 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6872  Acyl-CoA dehydrogenase  74.83 
 
 		 596 aa  893    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4177  Acyl-CoA dehydrogenase  75 
 
 		 596 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909918  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75 
 
 		 596 aa  894    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5773  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.5 
 
 		 596 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2538  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.07 
 
 		 596 aa  856    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000216055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1655  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.34 
 
 		 596 aa  924    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.34 
 
 		 596 aa  912    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1959  acyl-CoA dehydrogenase-like  68.87 
 
 		 596 aa  816    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.693184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2268  acyl-CoA dehydrogenase-like  70.43 
 
 		 593 aa  816    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.411151  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.64 
 
 		 595 aa  830    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.197154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0866  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  93.94 
 
 		 594 aa  1104    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.732712  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3141  acyl-CoA dehydrogenase-like  71.74 
 
 		 596 aa  860    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0936679  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  93.77 
 
 		 594 aa  1099    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1000  putative acyl-CoA dehydrogenase  76.85 
 
 		 596 aa  952    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0379  putative acyl-CoA dehydrogenase  76.6 
 
 		 595 aa  946    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.97 
 
 		 596 aa  831    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5363  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.83 
 
 		 596 aa  897    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  normal  0.255637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2983  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.5 
 
 		 596 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143309  hitchhiker  0.00237955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3285  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.55 
 
 		 593 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0739  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  75.93 
 
 		 594 aa  918    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00752028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.28 
 
 		 597 aa  829    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0235867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1555  acyl-CoA dehydrogenase-like  75 
 
 		 596 aa  894    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.341728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.67 
 
 		 596 aa  913    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.97 
 
 		 596 aa  831    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2393  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.47 
 
 		 596 aa  835    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.687624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3938  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.17 
 
 		 600 aa  801    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75 
 
 		 596 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.862607  normal  0.764481 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2553  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  83.47 
 
 		 367 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0929  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  83.47 
 
 		 367 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.712846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3596  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.53 
 
 		 593 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2488  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.85 
 
 		 595 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0227  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  50.92 
 
 		 592 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1028  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.09 
 
 		 593 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0637  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 		 592 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.58 
 
 		 586 aa  578  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0782  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.34 
 
 		 594 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.33 
 
 		 594 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17380  Acyl-CoA dehydrogenase  50.08 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00730937  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.01 
 
 		 593 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1156  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.06 
 
 		 615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2498  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.15 
 
 		 592 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.242453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4454  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.36 
 
 		 593 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2841  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.83 
 
 		 592 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4298  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.68 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3829  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.76 
 
 		 579 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.867715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4586  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.45 
 
 		 587 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0241066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4472  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.28 
 
 		 587 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.71418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4104  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.11 
 
 		 587 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  0.918519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16400  Acyl-CoA dehydrogenase  49.5 
 
 		 614 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0487  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.82 
 
 		 593 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.56 
 
 		 592 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0127  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.81 
 
 		 572 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.662664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0555  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.23 
 
 		 592 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0600  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.72 
 
 		 592 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198315  normal  0.545075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0435  Acyl-CoA dehydrogenase  52.64 
 
 		 589 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0986  acyl-CoA dehydrogenase  47.22 
 
 		 591 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1493  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.23 
 
 		 593 aa  522  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.15 
 
 		 589 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.602591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2644  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  52.3 
 
 		 593 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0656  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.35 
 
 		 586 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.73 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.9 
 
 		 592 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.57 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.57 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.73 
 
 		 592 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  46.83 
 
 		 600 aa  509  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0412  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.66 
 
 		 592 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  45.73 
 
 		 592 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1770  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.52 
 
 		 580 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.270198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0420  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.49 
 
 		 592 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.5 
 
 		 594 aa  505  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.97 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.57 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0528  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.13 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.71797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.74 
 
 		 593 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.23 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0835  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.26 
 
 		 585 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.48 
 
 		 596 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.23 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  42.93 
 
 		 597 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.8 
 
 		 597 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2105  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.87 
 
 		 600 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0867626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>