More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5533 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2393  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.57 
 
 		 596 aa  825    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.687624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0866  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.66 
 
 		 594 aa  886    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.732712  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.07 
 
 		 596 aa  826    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272289  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0925  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  75.34 
 
 		 594 aa  872    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.349332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.48 
 
 		 596 aa  1174    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75 
 
 		 594 aa  888    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.9 
 
 		 596 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5773  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  99.16 
 
 		 596 aa  1215    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.12 
 
 		 597 aa  806    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0235867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1298  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  70.4 
 
 		 596 aa  834    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1215  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  60.74 
 
 		 593 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1555  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  53.94 
 
 		 597 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000406482  normal  0.0195693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0929  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  94.12 
 
 		 367 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6368  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  75 
 
 		 594 aa  924    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  71.33 
 
 		 600 aa  882    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2548  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  76.51 
 
 		 594 aa  946    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 596 aa  1224    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2975  Acyl-CoA dehydrogenase  88.76 
 
 		 596 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3938  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.67 
 
 		 600 aa  865    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1225  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.8 
 
 		 596 aa  824    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311938  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6872  Acyl-CoA dehydrogenase  95.64 
 
 		 596 aa  1157    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4177  Acyl-CoA dehydrogenase  95.64 
 
 		 596 aa  1156    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909918  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2538  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.23 
 
 		 596 aa  836    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000216055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2265  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  59.13 
 
 		 598 aa  709    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.086163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1655  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  88.42 
 
 		 596 aa  1093    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1959  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.06 
 
 		 596 aa  813    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.693184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2268  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.43 
 
 		 593 aa  796    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.411151  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2553  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  94.12 
 
 		 367 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4282  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.4 
 
 		 596 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.87 
 
 		 596 aa  986    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3141  acyl-CoA dehydrogenase-like  70.23 
 
 		 596 aa  840    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0936679  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0514  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.89 
 
 		 595 aa  772    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1000  putative acyl-CoA dehydrogenase  82.05 
 
 		 596 aa  1019    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0379  putative acyl-CoA dehydrogenase  81.82 
 
 		 595 aa  1014    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5363  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.62 
 
 		 596 aa  1131    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  normal  0.255637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3285  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.06 
 
 		 593 aa  842    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.59 
 
 		 605 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220712  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0739  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  75 
 
 		 594 aa  916    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00752028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.9 
 
 		 596 aa  808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1555  acyl-CoA dehydrogenase-like  97.48 
 
 		 596 aa  1174    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.341728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2983  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  80.87 
 
 		 596 aa  1009    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143309  hitchhiker  0.00237955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  88.76 
 
 		 596 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.06 
 
 		 595 aa  796    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.197154 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2926  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  88.76 
 
 		 596 aa  1093    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  80.2 
 
 		 596 aa  979    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  97.48 
 
 		 596 aa  1174    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.862607  normal  0.764481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.01 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.712846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3596  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.71 
 
 		 593 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2488  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0227  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.59 
 
 		 592 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.42 
 
 		 594 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.43 
 
 		 593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17380  Acyl-CoA dehydrogenase  51.21 
 
 		 594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00730937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.67 
 
 		 586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0782  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.86 
 
 		 594 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0637  acyl-CoA dehydrogenase  49.66 
 
 		 592 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2498  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.17 
 
 		 592 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.242453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4472  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.37 
 
 		 587 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.71418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4454  Acyl-CoA dehydrogenase-like  50.86 
 
 		 593 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1156  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.48 
 
 		 615 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4104  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.11 
 
 		 587 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  0.918519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3829  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 		 579 aa  548  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.867715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1028  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.16 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4298  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.21 
 
 		 593 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4586  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.45 
 
 		 587 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0241066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0435  Acyl-CoA dehydrogenase  53.4 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16400  Acyl-CoA dehydrogenase  49.92 
 
 		 614 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1493  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.14 
 
 		 593 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.93 
 
 		 600 aa  531  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2841  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.38 
 
 		 592 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0656  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.18 
 
 		 586 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.87 
 
 		 592 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0600  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.64 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198315  normal  0.545075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2644  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  51.45 
 
 		 593 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0555  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.79 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0487  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.15 
 
 		 593 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1770  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.72 
 
 		 580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.270198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0127  acyl-CoA dehydrogenase-like  49.14 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.662664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.26 
 
 		 594 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.66 
 
 		 589 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.602591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0986  acyl-CoA dehydrogenase  45.39 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0528  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.65 
 
 		 592 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.71797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0835  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.43 
 
 		 585 aa  500  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0412  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.15 
 
 		 592 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.42 
 
 		 596 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0420  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.61 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3132  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.16 
 
 		 589 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2105  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.2 
 
 		 600 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0867626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.79 
 
 		 595 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.18 
 
 		 597 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  44.26 
 
 		 597 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.18 
 
 		 597 aa  495  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.2 
 
 		 597 aa  495  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.51 
 
 		 598 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.52 
 
 		 598 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.58 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.02 
 
 		 597 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  46.43 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  46.67 
 
 		 591 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.56 
 
 		 597 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>