More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2268 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.28 
 
 		 596 aa  810    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.618191 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2926  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.69 
 
 		 596 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0925  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  70.43 
 
 		 594 aa  805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.349332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2170  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.16 
 
 		 597 aa  763    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0235867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5773  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.43 
 
 		 596 aa  808    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2538  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.6 
 
 		 596 aa  793    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000216055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4282  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.44 
 
 		 596 aa  779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1298  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  66.61 
 
 		 596 aa  788    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1215  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  58.29 
 
 		 593 aa  688    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1555  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.94 
 
 		 597 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000406482  normal  0.0195693 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6368  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  68.65 
 
 		 594 aa  829    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3938  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.18 
 
 		 600 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2140  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  65.52 
 
 		 600 aa  795    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2548  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  68.18 
 
 		 594 aa  835    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2975  Acyl-CoA dehydrogenase  70.69 
 
 		 596 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5533  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.43 
 
 		 596 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.6 
 
 		 596 aa  809    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.59 
 
 		 596 aa  803    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1225  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.11 
 
 		 596 aa  801    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311938  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6872  Acyl-CoA dehydrogenase  69.26 
 
 		 596 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4177  Acyl-CoA dehydrogenase  69.26 
 
 		 596 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909918  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2297  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.11 
 
 		 596 aa  788    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  65.77 
 
 		 596 aa  787    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1655  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.83 
 
 		 596 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2265  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.31 
 
 		 598 aa  699    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.086163  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5363  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.02 
 
 		 596 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  normal  0.255637 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.6 
 
 		 596 aa  809    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.862607  normal  0.764481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1959  acyl-CoA dehydrogenase-like  65.77 
 
 		 596 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.693184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2268  acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 593 aa  1219    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.411151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0866  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.77 
 
 		 594 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.732712  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3141  acyl-CoA dehydrogenase-like  66.44 
 
 		 596 aa  804    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0936679  normal  0.0128827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1000  putative acyl-CoA dehydrogenase  68.45 
 
 		 596 aa  831    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0379  putative acyl-CoA dehydrogenase  68.34 
 
 		 595 aa  826    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3285  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  84.82 
 
 		 593 aa  1028    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0514  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.24 
 
 		 595 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0739  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.68 
 
 		 594 aa  820    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00752028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.69 
 
 		 596 aa  845    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0795  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.2 
 
 		 594 aa  824    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1555  acyl-CoA dehydrogenase-like  69.6 
 
 		 596 aa  809    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.341728  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.56 
 
 		 595 aa  824    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.197154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2983  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.9 
 
 		 596 aa  815    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143309  hitchhiker  0.00237955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.31 
 
 		 605 aa  757    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220712  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2808  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.11 
 
 		 596 aa  788    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2393  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.77 
 
 		 596 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.687624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.86 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.712846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2488  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.92 
 
 		 595 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3596  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.55 
 
 		 593 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0227  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  49.92 
 
 		 592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2553  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.35 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0929  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  75.35 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17380  Acyl-CoA dehydrogenase  50.09 
 
 		 594 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00730937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.72 
 
 		 594 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.09 
 
 		 586 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2638  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.43 
 
 		 593 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0637  acyl-CoA dehydrogenase  47.28 
 
 		 592 aa  555  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.337916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1028  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.23 
 
 		 593 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0782  acyl-CoA dehydrogenase-like  47.71 
 
 		 594 aa  545  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1156  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.04 
 
 		 615 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4586  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.91 
 
 		 587 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0241066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3829  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.08 
 
 		 579 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.867715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2498  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.12 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.242453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4104  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.24 
 
 		 587 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  0.918519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4454  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.19 
 
 		 593 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4472  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.07 
 
 		 587 aa  531  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.71418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2841  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.15 
 
 		 592 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4298  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.64 
 
 		 593 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.08 
 
 		 592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1493  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.58 
 
 		 593 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3266  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.13 
 
 		 596 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16400  Acyl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 		 614 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0435  Acyl-CoA dehydrogenase  50.96 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.24 
 
 		 594 aa  498  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.82 
 
 		 589 aa  498  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.602591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.26 
 
 		 598 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.76 
 
 		 598 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0835  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.79 
 
 		 585 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2644  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  49.21 
 
 		 593 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.33 
 
 		 600 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0986  acyl-CoA dehydrogenase  43.32 
 
 		 591 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0555  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.08 
 
 		 592 aa  492  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.539594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0656  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.54 
 
 		 586 aa  488  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.41 
 
 		 596 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.9 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0127  acyl-CoA dehydrogenase-like  45.66 
 
 		 572 aa  485  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.662664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  41.83 
 
 		 597 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.56 
 
 		 594 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.91 
 
 		 598 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  43.74 
 
 		 596 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0600  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.52 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198315  normal  0.545075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.26 
 
 		 593 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.87 
 
 		 592 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0420  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.65 
 
 		 592 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.36 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0412  acyl-CoA dehydrogenase family protein  44.44 
 
 		 592 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.91 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.21 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0528  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.87 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.71797  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.91 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.78 
 
 		 595 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1770  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.83 
 
 		 580 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.270198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>