104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0693 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  93.4 
 
 		 108 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  93.33 
 
 		 108 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  80.77 
 
 		 107 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  72.38 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  72.38 
 
 		 106 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  66.99 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  49.48 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  55.81 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  52.33 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  45.74 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  46.46 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  46.53 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  48.91 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  45.65 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  46.67 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  47.13 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  33.01 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  46.43 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  42.17 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  46.15 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  38.67 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  36.08 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  40.48 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  39.08 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  45.95 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  43.33 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  43.59 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  52.27 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  38.3 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  35.71 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  39.24 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  36.36 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  38.37 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  32.56 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  42.17 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  40.68 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  51.72 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  35.96 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  38.64 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  38.89 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  35.96 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  39.77 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  38.71 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  29.73 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  35.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  37.66 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  39.74 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  48.65 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  53.33 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  44.59 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  29.89 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  48.72 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  34.41 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  36.49 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  33.75 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.02 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  36.71 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  28.38 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  31.17 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  33.72 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  34.83 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  40.32 
 
 		 118 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  35.44 
 
 		 104 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  24.21 
 
 		 103 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  31.03 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  35.71 
 
 		 101 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  29.73 
 
 		 97 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  29.11 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  40.54 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  32.05 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  41.27 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  25.74 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0309  hypothetical protein  29.67 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.942799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  29.67 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  32.1 
 
 		 101 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  29.76 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  31.4 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  35.23 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  31.4 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>