135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0319 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  61.46 
 
 
97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  52.53 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  57.45 
 
 
101 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  54.17 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  51.04 
 
 
101 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  50.51 
 
 
104 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  46.81 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  46.51 
 
 
96 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  43.9 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  40.7 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  39.78 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  40.24 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  40 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  39.13 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  46.67 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  39.24 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  39.08 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  42.68 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  42.68 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  39.74 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  42.65 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  36.05 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  37.36 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  39.73 
 
 
102 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  41.18 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  41.18 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  38.27 
 
 
97 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  32.98 
 
 
99 aa  59.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  40.26 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  30.11 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  38.67 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  39.06 
 
 
105 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28.42 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  37.18 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  35.8 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  35.8 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  31.71 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  42.25 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  35.8 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  34.38 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  39.47 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  38.57 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  34.78 
 
 
73 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  41.89 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  26.67 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  38.89 
 
 
99 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.03 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  28.77 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  31.51 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  26.19 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  32.39 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  28.77 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  27.16 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  38.96 
 
 
105 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  23.71 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  37.88 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  32.05 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  27.63 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  34.29 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  40.7 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  32.05 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  33.73 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  29.63 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  34.78 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  30.43 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  25.81 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  37.18 
 
 
113 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  27.91 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  26.67 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  28.95 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  35.94 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  30.38 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  28.99 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  33.73 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  30.56 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  29.27 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  34.33 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  42.31 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  30.56 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  35.94 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  28.21 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  42.37 
 
 
74 aa  43.9  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>