93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3579 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  173  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  50.6 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  45 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  45.33 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  42.17 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  42.17 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  44.3 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  41.25 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  39.24 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  37.66 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  54.79 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  41.89 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  40.79 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  35.44 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  39.24 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  35.44 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  38.67 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.84 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  35.53 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  45.33 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  35.44 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  40.51 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  36.62 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  37.33 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  28.92 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  37.35 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  40.51 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  39.44 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  43.33 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  32 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  35.44 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  31.17 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  27.71 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  36.71 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  34.18 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  34.21 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  35.53 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  35.53 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  35.53 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  35.53 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36.62 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  40.28 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.1 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  36 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  34.18 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  31.65 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  32.05 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  30.99 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  34.67 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  28.21 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  34.67 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  34.78 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  35.44 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  32.43 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  37.18 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  31.33 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  32.91 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02253  DUF167 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06647)  32.43 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.279661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  32.88 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  38.16 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  29.73 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  34.21 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  30.56 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  41.77 
 
 		 108 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  32.05 
 
 		 95 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  32.88 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  33.77 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  39.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  30.86 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  31.17 
 
 		 92 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  34.21 
 
 		 96 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>