117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4153 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  206  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  67.33 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  66.34 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  46.6 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  46.94 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  46.53 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  44.66 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  45.74 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  46 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  48.84 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  48.84 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  43.43 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  51.28 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  45.56 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  48.86 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  44.44 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  42.22 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  48.19 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  48.28 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  42.42 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  41.57 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  54.44 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  39.24 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  41.56 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  38.3 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  47.22 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  36.25 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  41.56 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  45.12 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  32.98 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  41.67 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  38.2 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  40.26 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  37.35 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  40.66 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  37.37 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  54.55 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  44 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  36.84 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  36.84 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  40.82 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  42.67 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  27.59 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02253  DUF167 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06647)  39.51 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.279661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  27.63 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  31.91 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  34.74 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  33 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  30.85 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.14 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  34.44 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  35.8 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  31.17 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  32.47 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  38.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  36.05 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  38.67 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  36.9 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  30.26 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  35.16 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  34.88 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  35.8 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  36.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  28.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  35.14 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  29.7 
 
 		 95 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.93 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  31.87 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1603  hypothetical protein  26.26 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.213529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>