131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1417 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  60.92 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  49.41 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  54.17 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  48.35 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  49.46 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  60.53 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  56.98 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  40.54 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  43.04 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  46.34 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  30.67 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  39.74 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  48 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  31.94 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  31.94 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  41.43 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  38.67 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  47.06 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  26.39 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  41.18 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  36.9 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.56 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  30.56 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  32.88 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.91 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  36.9 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2229  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406139  normal  0.0156197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  31.4 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  37.84 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  36.9 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  36.05 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  43.21 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  48.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  24.71 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  39.77 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  41.1 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  31.17 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  29.17 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  41.43 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  36.99 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  33.73 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  42.42 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  35.53 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  41.43 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  38.55 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0260  conserved hypothetical protein TIGR00251, putative  33.71 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  32.43 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0437  protein of unknown function DUF167  33.71 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  31.71 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.29 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  35.71 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  31.51 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  40.96 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  29.17 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  29.33 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0847  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  28.95 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  32.43 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  28 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  31.08 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  40.28 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  38.46 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  28.38 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  35.06 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  31.08 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  45.07 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  30.23 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  32.88 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  32.39 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>