77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1896 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  60.53 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  53.76 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2229  hypothetical protein  57.89 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406139  normal  0.0156197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  53.85 
 
 		 92 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  54.88 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  45.57 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  35.53 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  47.56 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  32.89 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  36.84 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  31.58 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  48.65 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  38.96 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  32.89 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  27.27 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  51.32 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  42.11 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  43.42 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  47.3 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  34.57 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  29.07 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  42.67 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  35.16 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  32 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  35.62 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  44.59 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  33.78 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28.41 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  33.78 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  44.59 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  34.09 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  32.43 
 
 		 100 aa  42  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  32.43 
 
 		 100 aa  42  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  34.72 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  38.67 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  32.43 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  31.58 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  41.89 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  36.49 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  40.85 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  40.85 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  27.63 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  31.17 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  31.94 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  34.57 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>