101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0257 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  100 
 
 
73 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  37.31 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  37.31 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  37.68 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  32.86 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  35.82 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36.62 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  44.62 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  40.85 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  39.13 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  40.85 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  44.78 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  39.73 
 
 
75 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  37.88 
 
 
103 aa  52  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  34.78 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  36.23 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  28.99 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  35.53 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  28.95 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  28.99 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  31.88 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  36.62 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  30.43 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  37.31 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  39.13 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  27.63 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  36.92 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  28.99 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  30.99 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  33.8 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  29.73 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  29.58 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  31.43 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  40.91 
 
 
95 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.99 
 
 
95 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  31.88 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  28.38 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  30.99 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  36.62 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  36.62 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  25.71 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  37.31 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  27.63 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  29.58 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  31.08 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  33.8 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  32.86 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  31.08 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  30.99 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  28.38 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  28.99 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  38.03 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  30.43 
 
 
101 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  29.17 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  37.31 
 
 
99 aa  43.9  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  37.31 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  50 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  35.21 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  32.39 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  26.09 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1341  hypothetical protein  38.57 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.123342  hitchhiker  0.0000000187938 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  46.51 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  35.06 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  36.49 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  31.17 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  27.4 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  28.99 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  28.17 
 
 
96 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  26.09 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  34.25 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  28.17 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  34.29 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  34.78 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  25.35 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  28.99 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  28.99 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  28.99 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  37.14 
 
 
98 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  40.54 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  30.3 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  26.09 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>