136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3707 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  81.55 
 
 		 103 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  67.33 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  46.53 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  45.1 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  44.55 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  42.72 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  45 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  46.94 
 
 		 118 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  55.13 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  41.84 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  42 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  42 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  48.31 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  42.86 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  48.15 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  43.48 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  39.08 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  50.67 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  42.16 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  52.27 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  44.3 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  40.85 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  39.53 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  41.56 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  44.83 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.42 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  43.02 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  40.45 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  41.38 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  41.56 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  33.73 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  38.04 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  35.9 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  34.07 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  38.1 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  34.34 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  37.08 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  39.56 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.18 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  39.29 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  42.67 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  41.43 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  37.33 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  32.53 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  44 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  36.99 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  36.99 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  33.7 
 
 		 90 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  39.47 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  31.82 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  31.18 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  32.93 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  40.79 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  27.63 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  30.56 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  36 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  38.67 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  38.1 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  36.9 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.22 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  31.71 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  35.14 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  31.46 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  29.89 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  35 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  30.34 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  28.42 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  32.58 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  41.3 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  28.42 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  28.42 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  37.04 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>