90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0270 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  213  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  69.9 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  67.68 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  66.67 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  66.99 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  66.67 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  69.61 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  58.89 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  47.57 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  53.19 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  52.75 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  45.45 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  45.26 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  42.34 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  44.79 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  46.23 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  45.56 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  42.11 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  30.3 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  36.26 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  36.78 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  46.05 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  37.93 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  43.42 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  44.74 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  48.86 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  42.03 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  39.51 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  42.5 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  39.51 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  47.3 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.08 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  37.65 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  36.71 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  38.75 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  38.75 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  32 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  33.67 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  34.38 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  36.71 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  35.44 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  40.96 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  46.55 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  31.46 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  34.15 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  43.59 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  32.93 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  34.09 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  32.95 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  31.65 
 
 		 99 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  32.94 
 
 		 95 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  33.77 
 
 		 104 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  37.84 
 
 		 75 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.57 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  37.18 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  37.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  31.58 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>