78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2871 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  59.38 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  58.21 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  56.72 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  49.28 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  46.38 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  40.85 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  52.31 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  45.59 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  47.06 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  53.97 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  54.24 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  50.85 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  41.18 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  43.64 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  52.73 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  46.38 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  42.03 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  46.77 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  42.03 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  51.67 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  48.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  54.39 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  44 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  47.37 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  54.39 
 
 		 95 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  47.37 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  55.1 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  52.63 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  52 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  46.55 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  45.9 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  44.9 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  45.9 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  46 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  38.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  34.48 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  52.63 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  43.55 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  40.74 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  45.65 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  42.37 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  45.83 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  44 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  34.55 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  46.94 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  34.55 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  52.63 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  42.37 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  45.65 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  47.83 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  36.07 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  45.83 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  40.68 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  38.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  43.75 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  39.68 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  37.93 
 
 		 86 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>