76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3939 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  193  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  80.9 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  63.95 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  52.75 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  48.08 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  56.32 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  48.94 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  52.33 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  49.04 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  48.08 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  56.32 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  43.88 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  34.02 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  41.41 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  38.64 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  39.6 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  44.58 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  47.5 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  60.81 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  45.98 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  53.97 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  31.48 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  35.8 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  52.78 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  44.16 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  35.79 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  41.25 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  36.25 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  35.96 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  42.17 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  36.14 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  31.65 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  32.14 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  40.26 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  44 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  37.93 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  44.83 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  44.44 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  35.23 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  32.22 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  51.52 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  52 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  27.85 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  32.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  30.59 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  44.83 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  42.39 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  31.18 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  30.34 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  31.46 
 
 		 104 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  29.35 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  29.35 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  29.35 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  29.35 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  31.87 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  44 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  44 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  47.67 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>