63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0507 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  61.96 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  59.3 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  52.25 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  50.55 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  49.48 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  53.41 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  51.02 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  44.86 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  48.86 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  46.32 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  46.07 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  45.65 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  45.98 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  44.33 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  41.38 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  41.38 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  49.35 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  50.75 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  37.08 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  45.45 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  46.75 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  46.75 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  42.31 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  43.04 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  52.56 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  47.44 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  39.36 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.11 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  33.7 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  32.61 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  32.1 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  36.25 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  32.1 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  39.24 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  31.46 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  44.07 
 
 		 97 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  36.99 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  32.91 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  34.88 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  32.22 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  35.23 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  32.5 
 
 		 98 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  35.06 
 
 		 92 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  38.75 
 
 		 75 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  38.64 
 
 		 88 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  52.63 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  38.71 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  37.66 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  29.49 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  47.92 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  30.95 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>