110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3567 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  100 
 
 		 118 aa  228  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  47.57 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  47.47 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  46.94 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  46.46 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  48.08 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  54.43 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  43.43 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  44 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  46.32 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  48.91 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  44.44 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  44.68 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  43.88 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  44.68 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  43.62 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  44 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  42.35 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  48.68 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  52.31 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  39.8 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  52.78 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  36.84 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  38.96 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  39.19 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  37.84 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  37.84 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  37.04 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  40.26 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  35.53 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  32.26 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  45.83 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  32.63 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  45.57 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.04 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  48.28 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  38.46 
 
 		 104 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  32.18 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  30.85 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  31.33 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  35.8 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  34.78 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  40.28 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  35.56 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  37.63 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  37.5 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  31.76 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  31.65 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  40.79 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  36 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.58 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0485  hypothetical protein  28.12 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  31.33 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  31.91 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  39.47 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  31.03 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  30.49 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  31.03 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  32.05 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>