163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0959 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  42.27 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  46.74 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  38.71 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  44.09 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  44.09 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  44.09 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  44.09 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  48.68 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  56.92 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  47.56 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  38.95 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  44.94 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  47.5 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  40.22 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  48.68 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  53.85 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  43.16 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  36.96 
 
 		 99 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  42.67 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  36.96 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  53.85 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  45.56 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  37.08 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  47.37 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  45 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  45.57 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  52.31 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.66 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  42.31 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  46.05 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  47.95 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  42.22 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  40.24 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  46.58 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  44.87 
 
 		 100 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  38.55 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  44.59 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  39.29 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  41.25 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  42.67 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  42.67 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  41.25 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  41.25 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  42.67 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  45.07 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  42.67 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  44.74 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  39.08 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  38.37 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  39.53 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  39.76 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  41.77 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  31.96 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  42.11 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  43.84 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  39.44 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  44.16 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  44.78 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  39.73 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  31.4 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  38.96 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  38.16 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  38.71 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  36.59 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  38.36 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  40.22 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  34.41 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  41.27 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  36 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  40.22 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  40.85 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  41.77 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  43.06 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>