122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1075 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  200  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  174  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  84.54 
 
 		 97 aa  174  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  37.31 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  39.73 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  31.33 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  36.47 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  38.81 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.89 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  41.54 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  43.08 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  43.08 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  37.84 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  37.31 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  37.31 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  30.77 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  36.51 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  35.82 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  36.23 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  34.33 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  26.74 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  31.52 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  32 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  40.3 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  36.92 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  32.43 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  29.51 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  29.51 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  32.95 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  29.89 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  31.17 
 
 		 106 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  27.14 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  38.46 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  31.51 
 
 		 122 aa  47.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  28.77 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  33.78 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  36.76 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  27.91 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  31.88 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  28.77 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  29.49 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  29.52 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  34.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  36.07 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  32.47 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  34.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  26.25 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  31.43 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  30.43 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  32.2 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  32.86 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  31.08 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  29.41 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  35.38 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  31.34 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  29.49 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  27.27 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  23.81 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  35.59 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  28.79 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  29.17 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  29.17 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  29.17 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  28.79 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  29.52 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  29.17 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  29.23 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  32.86 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  36.62 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  31.82 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  32.86 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  29.17 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  32.86 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>