146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2130 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  200  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  98.1 
 
 		 105 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  82.86 
 
 		 110 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  48.84 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  46.67 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  45.56 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  46.67 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  40.78 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  48.24 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  44.68 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  44.57 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  56.72 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  45 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  43.53 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  41.86 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  52.63 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  40.48 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  40.22 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  38.82 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  52.63 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  35.29 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  37.65 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  41.98 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  52.63 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  51.32 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  40.24 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  39.33 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  41.98 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  42.22 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  34.07 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  38.95 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  43.04 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  38.27 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  28.71 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  40.22 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  28.71 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  28.71 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  28.71 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  45.33 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  58.54 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  32.53 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  38.82 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  43.02 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  33 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  41.11 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  36.96 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  37.37 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  29.7 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  29.7 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  37.78 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  35.9 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  35.96 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  30.69 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  32 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  29.7 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  29.7 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  29.7 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  29.7 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  36.9 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  29.59 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  34.57 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  38.89 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  28.12 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  31.43 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  29.59 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  47.14 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  37.23 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  34.41 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  34.44 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  35.63 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  38.46 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  33.77 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  41.03 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>