88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0058 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  81.13 
 
 		 108 aa  174  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  80.77 
 
 		 107 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  78.3 
 
 		 108 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  74.29 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  67.68 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  74.04 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  44.55 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  54.65 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  46.6 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  40.82 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  43.43 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  47.73 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  44.21 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  47.5 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  44.21 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  41.05 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  39.08 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  39.76 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  40.24 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  27.45 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  47.06 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  47.44 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  44.87 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  36.05 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  36.59 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  54.9 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  40.48 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  39.58 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  33.71 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  39.24 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  35.56 
 
 		 101 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  47.62 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  45.9 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  37.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  31.08 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  34.44 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  36.05 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  35.16 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  34.18 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  32.04 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  35.16 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  27.27 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  52.08 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  32.86 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  32.05 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  31.82 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  38.36 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1102  hypothetical protein  39.62 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.418533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  44.29 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  33.78 
 
 		 90 aa  42  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  30.68 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  35.16 
 
 		 92 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  42  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  39.76 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  42.86 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  42.53 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  26.47 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  35.14 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  32.14 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  36.49 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  39.19 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  28.95 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  32.43 
 
 		 113 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>