143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3610 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  84.21 
 
 
100 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  80.21 
 
 
96 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  80.21 
 
 
96 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  78.12 
 
 
96 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  157  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  78.12 
 
 
96 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  78.12 
 
 
96 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.380629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  79.17 
 
 
100 aa  155  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  79.17 
 
 
100 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  155  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  79.17 
 
 
96 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  78.12 
 
 
96 aa  154  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  78.12 
 
 
96 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  78.12 
 
 
100 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  80.21 
 
 
96 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  73.96 
 
 
96 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  72.92 
 
 
96 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  72.92 
 
 
96 aa  147  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  71.88 
 
 
100 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  84.88 
 
 
99 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  72.63 
 
 
96 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  74.47 
 
 
96 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  73.33 
 
 
96 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  69.79 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  69.79 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  68.75 
 
 
96 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  68.75 
 
 
96 aa  135  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  67.71 
 
 
96 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  68.42 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  68.42 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  68.42 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  68.42 
 
 
99 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  64.21 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  57.89 
 
 
99 aa  124  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  64.44 
 
 
90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  65.91 
 
 
95 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  64.84 
 
 
104 aa  120  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  60.87 
 
 
95 aa  120  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  63.41 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  73.24 
 
 
83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  66.27 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  54.55 
 
 
98 aa  103  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  50.56 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  50.65 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  46.84 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  46.34 
 
 
95 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  43.3 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  41.77 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  43.59 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  41.77 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  49.37 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  43.37 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  47.37 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  44.44 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  41.89 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  40.51 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  43.21 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  43.21 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  42.35 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  40.24 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  43.06 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  44.59 
 
 
105 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  43.06 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  41.38 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  43.66 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  41.1 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  35.16 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  39.76 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  40.74 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  44.93 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  35.44 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  41.1 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  37.35 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  37.97 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  37.21 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  37.35 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  38.1 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  37.21 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  37.5 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  38.16 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  36.36 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  52 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  52 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  42.86 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  40.43 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  39.51 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  41.54 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
101 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  32 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0260  conserved hypothetical protein TIGR00251, putative  38.89 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  32 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0437  protein of unknown function DUF167  38.89 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262204 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  36.62 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>