76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2620 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  85.87 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  79.57 
 
 		 101 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  81.52 
 
 		 99 aa  155  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  78.49 
 
 		 101 aa  155  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  80.9 
 
 		 100 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  76.53 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  76.84 
 
 		 107 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  76.92 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  65.12 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  67.05 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  39.77 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  38.37 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  35.29 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  31.18 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  39.76 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  39.76 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  34.83 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  37.8 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  37 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  37.78 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  38.55 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  31.03 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  38.82 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  34.94 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  35.87 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  36.25 
 
 		 100 aa  57  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  36.25 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  36.25 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  36.25 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  34.07 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  33.75 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  37.66 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.49 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  32.5 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.93 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  29.41 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  29.27 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  39.62 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  39.62 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  24.69 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  34.48 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  29.55 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0437  protein of unknown function DUF167  35.71 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0260  conserved hypothetical protein TIGR00251, putative  35.71 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  29.07 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  34.25 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  28.92 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  30.68 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  27.38 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>