87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0749 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  228  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  77.45 
 
 		 107 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  77.55 
 
 		 103 aa  158  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  76.53 
 
 		 106 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  68 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  74.23 
 
 		 113 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  67.71 
 
 		 101 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  70.53 
 
 		 99 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  71.43 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  61.22 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  65.12 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  40.45 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  40.45 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  37.65 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  41.18 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  42.35 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  40.91 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  41.46 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  36.47 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  37.36 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  37.97 
 
 		 90 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  37.21 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  36.05 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  31.82 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  38.27 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  33.73 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  36.9 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  40.74 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  36.9 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  38.1 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  35.16 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  36.26 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  35.8 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  35.16 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  35 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  35.16 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  38.1 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  31.4 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  32.58 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  33.66 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  39.02 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  28.57 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.94 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  39.02 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  31.33 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  37.8 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  45.45 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  32 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  43.48 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  39.06 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  35.38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  35.21 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  30.59 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  35.38 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  39.74 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  28.05 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  33.82 
 
 		 96 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  32.89 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  34.38 
 
 		 89 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.03 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  32.31 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  28.17 
 
 		 98 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>