129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5752 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  100 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  60.44 
 
 		 118 aa  93.6  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  54.17 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  47.19 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  54.79 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  45.59 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  48.1 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  42.05 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  42.05 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  38.89 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  42.11 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  42.05 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  43.06 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  40.91 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  53.25 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  32.18 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  43.84 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  52 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  42.03 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  43.84 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  36.99 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  38.36 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  37.84 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  36.11 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  39.73 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  39.73 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  36.59 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  44.3 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  45.07 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  40.51 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  40.23 
 
 		 95 aa  50.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  34.72 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  36.62 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  40.28 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  38.03 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  36.11 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  35.48 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  45.59 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  45.57 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  40.58 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  41.67 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  28.77 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  33.7 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  35.48 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  37.84 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  33.78 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  47.69 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  40.28 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  30.14 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  44.87 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  45.45 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  43.18 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  39.47 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  35.21 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2229  hypothetical protein  49.38 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406139  normal  0.0156197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  43.75 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  36.62 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  46.88 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  43.06 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  37.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  31.65 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  39.47 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  46.88 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  36.71 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  40.85 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  39.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  39.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  38.16 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02253  DUF167 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06647)  37.84 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.279661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  42.25 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  38.03 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  39.74 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  41.46 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  42.25 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  36.84 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  37.31 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  35.62 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>