120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2458 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  96.47 
 
 		 85 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  86.08 
 
 		 84 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  69.62 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  59.21 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  52.94 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  51.28 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  51.52 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  42.17 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  42.86 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  41.86 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  48.72 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  51.47 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  46.75 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  43.06 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  42.47 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  45.21 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  39.73 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  41.56 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  43.28 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  43.84 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  39.73 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  48 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  46.05 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  38.67 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  49.21 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  38.81 
 
 		 103 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  43.28 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  43.28 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  38.46 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  50.98 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  36 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  39.74 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  32.86 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  39.74 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  41.79 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  41.03 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  43.08 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  36.99 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  41.18 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  36.11 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  37.31 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02253  DUF167 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06647)  38.1 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.279661 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  32.35 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  40.3 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  39.71 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  39.06 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  50.68 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  31.88 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  40.58 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  34.72 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  36.23 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  39.47 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  32.56 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  33.82 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  34.29 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  31.43 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  42.25 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  36.76 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  31.75 
 
 		 99 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  44.29 
 
 		 94 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  47.83 
 
 		 74 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 101 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  44.59 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  35.82 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>