114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0667 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  200  4e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  41.54 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  45.59 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  33.7 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  40.58 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.95 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  35.82 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  38.24 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  38.27 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.52 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  30.59 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  54.55 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  49.21 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.28 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  38.24 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  49.21 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  36.11 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  41.43 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  30.12 
 
 
102 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  36.49 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  28.89 
 
 
90 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  31.94 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  37.14 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.18 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  45.33 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  42.25 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.59 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  33.75 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  41.43 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  37.68 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  35.82 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  38.89 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  28.24 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  35 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  40.85 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  42.35 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  32.81 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  38.89 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  32.39 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  42.86 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  39.44 
 
 
95 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  36 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  41.07 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  44.93 
 
 
92 aa  47.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  35.14 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  36.99 
 
 
106 aa  47.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  27.14 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  39.44 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  40.58 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  39.73 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  38.24 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  32.84 
 
 
73 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  34.92 
 
 
96 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  34.33 
 
 
98 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  33.82 
 
 
98 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  32.86 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  38.1 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  36.92 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  25.77 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  31.82 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  37.97 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  33.82 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  40.28 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  33.78 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  38.24 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  36.92 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  31.43 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  28.77 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  32.5 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  32.29 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  32.5 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  36.62 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  36.71 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  35.29 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  42.37 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  31.08 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  32.5 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  32.81 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  30.77 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  31.71 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>