56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0608 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  203  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  89.62 
 
 		 106 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  72.38 
 
 		 107 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  74.29 
 
 		 107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  70.19 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  69.23 
 
 		 108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  66.67 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  56.32 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  41.84 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  54.02 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  45.65 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  45.65 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  44 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  43.96 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  43.43 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  40.66 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  44.57 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  45.05 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  35.92 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  48.48 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  43.59 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  48 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  46.58 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  38.55 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  47.3 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  37.76 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  48.81 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  42.7 
 
 		 91 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  37.8 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  38.1 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  40.96 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  39.76 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  41.1 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  37.97 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  40.28 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  43.75 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  35.53 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  43.86 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  31.4 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  39.73 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  45 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  45.71 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  31.17 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  45.76 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  37.18 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  33.72 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  37.8 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  36.84 
 
 		 84 aa  40  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>