118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  227  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  60.44 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  49.47 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  48.35 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  51.35 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  36.26 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  43.33 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  38.64 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  38.36 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  41.03 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  31.17 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  31.87 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  34.67 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  34.18 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  31.52 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  35.44 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  39.44 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  45.88 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  32.91 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  38.89 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.12 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  38.03 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  47.95 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  36.59 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  34.67 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  45.33 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  38.78 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2229  hypothetical protein  46.67 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406139  normal  0.0156197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  30.67 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  34.25 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  30.67 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  32.26 
 
 		 105 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  26.14 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  30.14 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  38.14 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  32 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  33.75 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  36.05 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.84 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0437  protein of unknown function DUF167  36.08 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000262204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0260  conserved hypothetical protein TIGR00251, putative  36.08 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  39.19 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  31.18 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  31.87 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  28.95 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  30.68 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  31.18 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  42.11 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  30.12 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  36.11 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  27.4 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  29.07 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  29.07 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  30.23 
 
 		 96 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  30.23 
 
 		 96 aa  43.9  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  30.67 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  31.11 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  35.23 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  29.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  32.43 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  42.39 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  29.07 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  30.23 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  30.12 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  29.07 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  32.43 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  26.67 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  51.72 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>