25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2229 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2229  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  230  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406139  normal  0.0156197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  54.44 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  57.89 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  46.67 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  46.67 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  49.38 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  44.44 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  47.92 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  31.18 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  32.89 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  35.29 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  40.51 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  45.16 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  31.65 
 
 		 97 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  27.4 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  27.4 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  32.56 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  30.34 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  33.71 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  26.32 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  43.18 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  35.48 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>