69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5738 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  100 
 
 
92 aa  176  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  62.03 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  49.41 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  47.19 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3204  hypothetical protein  51.11 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.845334 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  43.33 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  52.75 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  36.25 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0486  hypothetical protein  51.19 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.176683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  47.22 
 
 
101 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36.11 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  35.71 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  35 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  42.42 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  35.21 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  35.44 
 
 
90 aa  48.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  28.89 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  30.59 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  27.78 
 
 
99 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  40.85 
 
 
85 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  27.78 
 
 
99 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  27.78 
 
 
99 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  27.78 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1896  hypothetical protein  53.85 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0138471  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  38.89 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  30.67 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.26 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  28.74 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  31.03 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  28.09 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  30.68 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  36.23 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  34.83 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  31.08 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  30.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  41.03 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  31.71 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  31.88 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  33.75 
 
 
95 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0437  protein of unknown function DUF167  35.53 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000262204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0260  conserved hypothetical protein TIGR00251, putative  35.53 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  34.29 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  40.85 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  37.97 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  31.82 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  38.67 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  32.95 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  34.83 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.29 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  38.71 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  34.62 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  31.82 
 
 
99 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  35.16 
 
 
107 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  32.89 
 
 
98 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  30.68 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  37.63 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  34.44 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  23.38 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  41.43 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  39.71 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  29.17 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  30.86 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  30.26 
 
 
96 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>