66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0071 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  53.85 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  53.16 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  47.83 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  47.37 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  48.39 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  46.99 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  48.61 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  36.11 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  41.25 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  52.78 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  41.77 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  42.17 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  50 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  45.71 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  42.86 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  42.31 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  48.68 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  48.65 
 
 
107 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 
73 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  44.59 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  42.03 
 
 
97 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  48 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  42.86 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  36.26 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  27.14 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  44.29 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  34.78 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  48 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  38.57 
 
 
98 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  27.14 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  36.23 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  35.82 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  36.23 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  43.59 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  44.29 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  36.92 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2133  hypothetical protein  47.76 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  42.31 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  34.33 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  31.43 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  34.33 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  37.84 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  38.03 
 
 
89 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5738  protein of unknown function DUF167  37.97 
 
 
92 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  45.71 
 
 
106 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  39.06 
 
 
101 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  40 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  36.23 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  46 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  33.78 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02253  DUF167 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06647)  36.11 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.279661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  39.19 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.16 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  34.85 
 
 
106 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>