83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0912 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  207  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  69.66 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  68.54 
 
 
99 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  68.6 
 
 
103 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  68.6 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  64.04 
 
 
101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  65.12 
 
 
106 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  62.92 
 
 
101 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  65.12 
 
 
114 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  60.64 
 
 
113 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  58.43 
 
 
111 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  42.53 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  36.78 
 
 
98 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.88 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  41.67 
 
 
96 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  34.52 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  33.72 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  36.78 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  36.05 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  40.48 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  36.9 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  40.48 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  37.93 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  33.72 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  40.48 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  40.48 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  40.48 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  40.48 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  35.29 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  37.35 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  34.94 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  35.71 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  35.29 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  35.29 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  36.14 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  36.14 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  39.29 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  38.27 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  34.12 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  36.14 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  34.52 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  34.94 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  36.47 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  33.75 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  33.73 
 
 
101 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  35.9 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  31.17 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  36.49 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  32.5 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  32.91 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  30.86 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  33 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  39.06 
 
 
89 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2772  hypothetical protein  26.87 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  34.29 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2644  hypothetical protein  26.87 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  35.71 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  34.92 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  32.91 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  32.97 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  31.71 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  39.06 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  28 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  26.39 
 
 
103 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  27.63 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32.39 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>