136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1134 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  74.74 
 
 		 96 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  72.92 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  72.63 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  70.53 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  70.53 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  65.26 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  65.26 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  67.37 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  72.63 
 
 		 99 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  67.37 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  67.37 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  67.37 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  66.32 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  72.63 
 
 		 99 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  72.63 
 
 		 99 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  72.63 
 
 		 99 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  65.96 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  69.47 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  68.48 
 
 		 95 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  68.42 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  63.16 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  70.65 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  69.57 
 
 		 95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  67.37 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  65.96 
 
 		 96 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  66.32 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  69.77 
 
 		 99 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  57.89 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  65.91 
 
 		 98 aa  124  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  64.04 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0540  hypothetical protein  73.33 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  62.22 
 
 		 104 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  54.74 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  63.29 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  44.79 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  41.67 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  42.71 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  45.57 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  41.98 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  42.31 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  41.03 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  40.54 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  40.74 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  46.58 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.65 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  39.51 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2664  hypothetical protein  40.7 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0569679  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  37.18 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  43.48 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0749  hypothetical protein  36.05 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000231934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2508  protein of unknown function DUF167  36.78 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  41.86 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1715  protein of unknown function DUF167  37.65 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.625283  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0102  hypothetical protein  44.87 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  42.25 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  42.47 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0253  protein of unknown function DUF167  36.78 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0379  hypothetical protein  37.78 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.650719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  39.44 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3071  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0227257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2620  hypothetical protein  37.8 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0145  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2104  hypothetical protein  36.47 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  35.06 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  41.54 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  31.82 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  41.27 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  34.62 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  34.62 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  32.5 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  37.35 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  41.56 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  30.77 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3430  hypothetical protein  37.8 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.367797  decreased coverage  0.0057855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  29.73 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05120  hypothetical protein  45.1 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  33.77 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0491  hypothetical protein  45.1 
 
 		 56 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  37.66 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  36.23 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  36.14 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  32.88 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>