136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2066 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  100 
 
 		 101 aa  205  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  52.53 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  52.53 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  53.12 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  50 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  47.73 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  38.54 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  42.35 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  41.77 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  41.98 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  42.35 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  41.67 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  48.68 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  41.67 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  40.74 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  39.51 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  40.48 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  42.47 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  34.74 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  45.95 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  34.21 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  34.12 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  32.93 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  32.93 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  32.93 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  32.93 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.1 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  34.12 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  35.8 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  41.79 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  30.67 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  41.79 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  40.3 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  34.72 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  30.86 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  29.27 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.49 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3359  hypothetical protein  36.84 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0827  hypothetical protein  35.62 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.383726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0141  hypothetical protein  35.62 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0828  hypothetical protein  35.62 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1134  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000408798  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3453  hypothetical protein  39.06 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  32.05 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02783  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0792239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0742  protein of unknown function DUF167  37.88 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4256  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.863374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02746  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0692262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002453  hypothetical protein  29.49 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0010  hypothetical protein  32.93 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3113  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0761  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.928779  hitchhiker  0.000411428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3095  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3385  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  37.33 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03581  hypothetical protein  32.05 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3349  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.113013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3341  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.380629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3276  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0223832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3265  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3445  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.17166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0757  protein of unknown function DUF167  37.5 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  30.49 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0294  hypothetical protein  34.72 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.101586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  40.91 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  34.29 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  24.42 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  30.56 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  34.72 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  32.47 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3043  hypothetical protein  30.38 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  31.03 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  34.25 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  31.03 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  29.89 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  29.29 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1378  protein of unknown function DUF167  28.77 
 
 		 73 aa  48.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  38.81 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>