85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0151 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  100 
 
 
106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  55.32 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2170  hypothetical protein  52.87 
 
 
118 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  44.79 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0406  protein of unknown function DUF167  41.67 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  46.84 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  40 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  50.67 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  52 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  45.33 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  48 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  49.33 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  38.75 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  45.33 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  44.16 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  34.78 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  41.89 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0384  hypothetical protein  40.28 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0121428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  40.54 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  42.65 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  37.8 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1117  hypothetical cytosolic protein  36.23 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  50.85 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  40.51 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  44.12 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  45.83 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  44.44 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  40 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  37.04 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1103  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  41.27 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1075  hypothetical protein  31.17 
 
 
97 aa  48.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.500993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  37.65 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  36 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  39.71 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.14 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  41.54 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  52.63 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  42.31 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  38.81 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  39.74 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0569  protein of unknown function DUF167  35.38 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  39.74 
 
 
107 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  36.67 
 
 
116 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4812  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  0.209733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  45.9 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  35.21 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  38.24 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  39.68 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  42.03 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2415  protein of unknown function DUF167  36.49 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  38.24 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  38.82 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  37.97 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  37.97 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  39.47 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1458  protein of unknown function DUF167  39.71 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  36.49 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  33.77 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  37.14 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  29.58 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  33.78 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  27.78 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  30.14 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  40.51 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  37.66 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2081  hypothetical protein  33.78 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1657  hypothetical protein  30.16 
 
 
99 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  39.74 
 
 
106 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1218  protein of unknown function DUF167  34.85 
 
 
84 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  35.29 
 
 
89 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  36.67 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  39.71 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  38.96 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  40 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  37.66 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  40.26 
 
 
118 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2040  protein of unknown function DUF167  40.26 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  29.17 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>