100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3232 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  225  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3567  protein of unknown function DUF167  48.08 
 
 		 118 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  42.34 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  46 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  45.83 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  45.65 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  45.65 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  41.84 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  47.73 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  39.8 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3628  protein of unknown function DUF167  47.56 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  46.67 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  45.05 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  43.18 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  39.53 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1371  hypothetical protein  45.45 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  54.05 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2871  hypothetical protein  49.28 
 
 		 74 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0052  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  43.96 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2087  protein of unknown function DUF167  37.93 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.969558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2896  hypothetical protein  45.56 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3887  hypothetical protein  39.8 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.117931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2407  protein of unknown function DUF167  37.78 
 
 		 105 aa  57  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.287495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  37.78 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0959  hypothetical protein  33.65 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0262129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1694  hypothetical protein  39.78 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.752455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  39.24 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  33.7 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1495  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  37.08 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  38.37 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  36.78 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  37.35 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03050  hypothetical protein  37.65 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.600451  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  38.89 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  39.29 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4719  protein of unknown function DUF167  36.17 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.728799  normal  0.483345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1104  hypothetical protein  37.08 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00701421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27290  hypothetical protein  38.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.202729  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4205  hypothetical protein  39.08 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.783876  hitchhiker  0.00855643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0579  hypothetical protein  38.46 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  43.24 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  38.96 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3569  hypothetical protein  44.59 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0995374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0151  protein of unknown function DUF167  36.67 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0166338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3894  hypothetical protein  34.67 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2915  protein of unknown function DUF167  36.26 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0338  hypothetical protein  38.82 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0664728  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0413  protein of unknown function DUF167  32.32 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00525213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1164  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107614  hitchhiker  0.00933281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1664  protein of unknown function DUF167  40 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.915466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  42.67 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1018  hypothetical protein  46 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000214259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2846  hypothetical protein  43.06 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  35.96 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  31.08 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  32.97 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0022  hypothetical protein  30.61 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  38.67 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  32.86 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  32.56 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5752  protein of unknown function DUF167  41.46 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2029  hypothetical protein  28.89 
 
 		 98 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0278009  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1126  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179609  hitchhiker  0.00222352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1087  hypothetical protein  37.65 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1494  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1868  protein of unknown function DUF167  36.36 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  43.42 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4760  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2722  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  34.52 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0319  hypothetical protein  34.41 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1417  hypothetical protein  36.14 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0945672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000104044  hitchhiker  0.0000645688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1146  protein of unknown function DUF167  36.47 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000838616  normal  0.159887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000974093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1292  hypothetical protein  29.17 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00304855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1215  protein of unknown function DUF167  35.29 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1753  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.236279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2066  protein of unknown function DUF167  35.06 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0673  protein of unknown function DUF167  31.58 
 
 		 73 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  34.72 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  34.72 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0841  hypothetical protein  27.71 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>