61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0696 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  176  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.0152962 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2174  hypothetical protein  64.56 
 
 		 82 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0800  hypothetical protein  59.21 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2458  hypothetical protein  59.21 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0379  hypothetical protein  55.26 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3579  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02050  hypothetical protein  47.44 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0071  hypothetical protein  47.14 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5214  protein of unknown function DUF167  47.83 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0948  hypothetical protein  40.51 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0257  protein of unknown function DUF167  44.78 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3654  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.942971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0667  hypothetical protein  44.93 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0772  protein of unknown function DUF167  31.51 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0407  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0693  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3526  hypothetical protein  39.24 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3000  hypothetical protein  36.11 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0608  hypothetical protein  41.1 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0109  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.540517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1019  protein of unknown function DUF167  37.04 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5352  hypothetical protein  40.86 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0418  hypothetical protein  34.48 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4156  protein of unknown function DUF167  40.58 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3939  hypothetical protein  40.26 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1261  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0266774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1124  hypothetical protein  31.94 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000681191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5322  hypothetical protein  41.51 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1329  hypothetical protein  30.56 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0289  hypothetical protein  37.68 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1056  protein of unknown function DUF167  38.03 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0270  hypothetical protein  34.15 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3356  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1190  hypothetical protein  34.29 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0932576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4153  hypothetical protein  32.86 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.711245 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0912  hypothetical protein  32.97 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.671997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0058  hypothetical protein  38.36 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1167  hypothetical protein  38.89 
 
 		 102 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000704589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0507  hypothetical protein  35.06 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1229  hypothetical protein  30 
 
 		 95 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000279733  normal  0.270499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2690  hypothetical protein  32.86 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1088  protein of unknown function DUF167  32.14 
 
 		 98 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0617  hypothetical protein  32.93 
 
 		 95 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000015411  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1684  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1733  protein of unknown function DUF167  47.06 
 
 		 106 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.933346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1666  protein of unknown function DUF167  33.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0864  hypothetical protein  33.78 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2863  hypothetical protein  31.43 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0097792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1191  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0328  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4033  hypothetical protein  29.33 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4028  hypothetical protein  34.25 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1341  hypothetical protein  34.33 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.123342  hitchhiker  0.0000000187938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0479  hypothetical protein  38.96 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4080  hypothetical protein  32 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012749  normal  0.0309367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2130  hypothetical protein  34.18 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0717  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3232  hypothetical protein  35.44 
 
 		 116 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>